宮崎大学医学部附属病院の最大の強みは、あらゆる医学領域を網羅する広範な診療科一覧と、各領域の学会専門医・指導医が揃う高度なチーム医療です。内科系（循環器内科、消化器内科、呼吸器内科、血液・糖尿病・内分泌内科など）から外科系（心臓血管外科、消化器外科、脳神経外科、整形外科など）、さらには小児科、産婦人科、眼科、耳鼻咽喉科、皮膚科、放射線科、麻酔科に至るまで、多職種が密接に連携しながら高度な医療を提供しています。
各診療科の外来担当医スケジュールは、大学病院の公式サイトや院内掲示で月ごとに更新されています。ただし、大学病院の医師は外来診療だけでなく、手術、病棟回診、学生指導、臨床研究、国内外の学会参加などを兼任しています。そのため、担当医の急な出張や手術対応によって休診・代診が発生する場合がある点には配慮が必要です。特定の専門医による診察を希望する場合は、事前に外来診療割当表を確認した上で紹介状を作成してもらうことが確実です。
また、同院を象徴するもう一つの機能が高度救命救急センターとドクターヘリの基地病院運用です。南北に長く山間部も広がる宮崎県において、救急医とフライトナースを乗せたドクターヘリは、遠隔地や過疎地域から重症患者を30分以内に同院へ直接搬送するライフラインとして稼働しています。年間数百件に及ぶ出動実績は、地域救急の生存率向上に決定的な貢献を果たしています。
