人気ナンバープレートの選択には、一般にはあまり語られないデメリットや誤解が存在します。第一に挙げられるのが、防犯・プライバシー上の脆弱性です。「1」や「8888」、「358」のような認知度の高いナンバーは、通行人や近隣住民の記憶に極めて残りやすい特徴を持ちます。
警察関係者の証言や防犯コンサルタントの知見によれば、「あの車が今どこに停まっているか」「何時に帰宅したか」という生活行動パターンが第三者に筒抜けになりやすいリスクがあります。特に女性の一人暮らしや高級車の場合、ストーカー被害や車上荒らし、車両盗難の標的としてマークされやすくなる危険性は否定できません。
また、インターネット上には「希望ナンバーを付けると下取りや中古車買取価格が上がる」という噂が散見されますが、これは完全な誤解です。査定のプロフェッショナルである日本自動車査定協会の基準において、ナンバープレートの数字が車両本体の価値に加点されることは一切ありません。下取り時にはナンバーは抹消または変更されるのが通例であり、売却時の経済的メリットはゼロです。
さらに、希望ナンバー取得手続きにおける手戻りにも注意が必要です。希望番号の予約は一般社団法人全国自動車標板協議会の専用ウェブサイト「希望番号・図柄ナンバープレート申込サービス」から自身で行うことができますが、交付手数料の支払期限や予約済証の有効期限（通常1か月）を過ぎると無効になります。ディーラーに代行を依頼する場合は、代行費用として1万円から2万円前後の手数料が別途上乗せされるのが通常です。
