ネット上の口コミ・評判やSNSの投稿を精査すると、一部で「規模が小さく短時間で見終わってしまうのではないか」「大型のイルカショーがない」といった声が見受けられます。しかし、これは総合型メガ水族館と同じ基準で比較してしまっていることによる誤解と言えます。
本館はエンターテインメント型の大型複合水族館ではなく、「ペンギンの生態観察と保全・教育」に特化した専門館です。派手なアトラクションショーこそありませんが、水深ごとの泳ぎ方の差異や、種類ごとの性格の違い、羽毛の質感まで肉眼でじっくり観察できる展示デザインが採用されています。また、館内には長崎の淡水魚や橘湾の沿岸生物を紹介するコーナーも併設されており、地域の生態系を深く学べる構成になっています。
また、混雑状況に関しても事前の把握が不可欠です。平日は修学旅行生が重ならない限り非常に落ち着いており、ペンギンと1対1で向き合える静寂な空間が広がります。一方で、GWやお盆、土日祝日の11:00〜14:00はファミリー層を中心に駐車場やエサやり体験の受付窓口がピークを迎えます。ゆったりと観察を楽しみたい場合は、開館直後の9:00〜10:30、もしくは15:00以降の夕方を狙うのが賢明な立ち回りです。