水戸四中を語る上で欠かせないのが、文武両道を体現する部活動の活発さです。市内外から高い評価を受ける部活動が複数存在し、生徒たちの自己肯定感や協調性を育む大きな柱となっています。
筆頭に挙げられるのが水戸四中吹奏楽部です。茨城県内屈指の伝統と実力を誇り、吹奏楽コンクールやアンサンブルコンテストにおいて、地区大会や県大会を突破し東関東大会、さらには全日本吹奏楽コンクールへの出場経験を持つ強豪として広く知られています。日々の練習密度は高く、パートリーダーを中心とした自律的な合奏練習と、指導陣による緻密な表現指導が高次元で結実しています。「四中の吹奏楽部で演奏したい」という明確な動機を持って入学してくる生徒も少なくありません。
運動部においては、水戸四中サッカー部が安定した強さを見せています。水戸市総体や中央地区大会で常に上位を争い、県大会進出の常連校として名を連ねています。地域のジュニアクラブチームで基礎を磨いてきた選手と、中学から真剣に打ち込む選手が切磋琢磨し、組織的なパスサッカーを展開。近隣の強豪クラブチームに引けを取らない戦術理解とフィジカル強化が図られています。このほかにも、陸上競技やソフトテニス、バスケットボールなど多彩な部が精力的に活動しており、放課後の校庭や体育館には常に活気が満ちています。
