木曽川を渡り岐阜県側に入ると、豊臣秀吉の出世譚で名高い「墨俣一夜城」の舞台となった墨俣宿に到着します。長良川と揖斐川に挟まれた輪中地帯に位置し、本陣跡の遺構や風情ある格子戸の民家が軒を連ねます。
さらに西へ進むと、美濃路最大の城下町宿場である大垣宿が姿を現します。大垣城は関ヶ原の戦いにおいて西軍・石田三成が本陣を置いた最重要拠点であり、美しい四層の天守が再建されています。城下を巡る水門川沿いは「水の都」と称される大垣を象徴する景観で、松尾芭蕉が『おくのほそ道』の旅を結んだ地としても全国的に著名です。
大垣宿を抜けると、道は中山道との合流点である垂井宿へと向かいます。垂井の追分には「是より右 東海道あつたみち/左 木曽路」と刻まれた巨大な道標が立ち、二つの大動脈を結び抜いた美濃路踏破の達成感を静かに演出してくれます。