「三つ子の魂百まで」は医学的に本当なのか――この疑問に対し、近年の三つ子の魂百までと脳科学の知見は、「基盤形成の観点では事実だが、運命決定論としては嘘である」という明確な回答を出しています。
人間の脳重量は、出生時に約350〜400グラムですが、急速な発達を経て3歳頃までに成人の約80%に達します。この時期の乳幼児の脳内では、神経細胞同士をつなぐシナプスが過剰なほど爆発的に増殖します。その後、周囲の環境や刺激に応じて「よく使う神経回路」が太く強化され、「使われない回路」は整理・淘汰されていく「シナプス・プルーニング（刈り込み）」という生理現象が起こります。情動の制御を担う大脳辺縁系や、安心感の土台となる扁桃体の過敏性などは、この乳幼児期の環境刺激を浴びてチューニングされるため、刺激に対する基本的な感受性や気質が3歳前後で大枠作られるのは生理学的な事実です。
行動遺伝学のデータによれば、外向性・神経症的傾向・協調性といった個人の「パーソナリティ」の約40〜50%は遺伝的要因に左右されます。残り半分の環境要因のうち、3歳までの親子関係や生活刺激が「基底的な感情の反応パターン」を構築することは確かです。しかし、近年の脳科学が証明した最大の発見は「脳の神経可塑性（Plasticity）」です。脳の配線は3歳で固定化されるわけではなく、前頭前野を中心とする高次認知機能は20代半ばまで発達を続けます。「三つ子の魂百まで」を「3歳で人生の器が完成し、以降は一切修正がきかない」と解釈するのは、現代科学から見れば完全な誤謬（ごびゅう）にほかなりません。
