荒川流域のビオトープ群において、訪問者が最も息をのむ瞬間は、水辺に広がる野鳥たちの営みです。荒川ビオトープの野鳥観察では、清流のシンボルであるカワセミをはじめ、冬季にはマガモやコガモ、オカヨシガモなどのカモ類が数多く飛来します。上空にはオオタカやノスリ、チョウゲンボウといった猛禽類が旋回し、豊かな食物連鎖が形成されている事実を物語っています。
水生環境に目を向けると、荒川ビオトープの生息生物は実に多彩です。かつてのワンド（本流とつながる緩やかな淀み）や池沼には、メダカやモツゴ、トウヨシノボリなどの在来魚が生息しています。春から初夏にかけては、シュレーゲルアオガエルやトウキョウダルマガエルの鳴き声が響き渡り、抽水植物の間をギンヤンマやシオカラトンボが飛び交います。
国土交通省荒川上流河川事務所や各自治体の環境調査報告によると、適切な植生管理と外来種駆除の継続によって、絶滅危惧種に指定されている水生植物（ミズアオイやアサザなど）の自生も確認されています。四季折々で表情を変える水辺のランドスケープこそ、荒川ビオトープ最大の見どころです。
