浜松科学館を訪れる際、最も留意すべきなのが「専用の一般駐車場が存在しない」という点です。館前には障害者用スペースおよび大型バス専用枠のみが用意されており、自家用車で来館する場合は近隣の有料コインパーキングを利用しなければなりません。
ゴールデンウィークやお盆休み、3連休などの繁忙期には、科学館周辺の小規模パーキングが午前10時台で満車になるケースが頻発します。車でのアクセスを検討している場合は、浜松駅周辺の大規模駐車場（駅周辺の立体駐車場やアクトシティ周辺）を利用し、最大料金が適用される場所を事前に確保しておくのが安全です。
もっとも合理的なアクセス方法は、JR浜松駅南口からの徒歩ルートです。南口を出て東方向へ線路沿いを直進するだけで約7分で到着するため、道順に迷う心配はほぼありません。遠方から新幹線で訪れる旅行者にとっても、交通ストレスが極めて少ない好立地と言えます。
