宿泊施設としての完成度を決定づけているもう一つの柱が、最上階の12階に設けられた天然温泉 夕凪の湯です。境港市内の宿泊施設で最上階に展望露天風呂を備えている例は希少であり、昼は遠くに秀峰・大山（だいせん）や日本海、夜は境水道を行き交う船の明かりを一望できるパノラマビューが広がります。
泉質は「ナトリウム・カルシウム-塩化物温泉」。高濃度の塩分を含む泉質は、湯冷めしにくく保温効果が非常に高いため、旅の疲労を芯から解きほぐす効能があります。内湯には広々とした主浴槽のほか、壺風呂や寝湯も完備されています。
近年、特に熱烈な支持を後押ししているのが御宿野乃境港 サウナのスペックです。温浴施設マニアやサウナーから高評価を受ける理由は、その妥協のない設計にあります。
サウナ室は90度前後に設定された本格的なドライサウナで、ヒノキの香りが漂う清潔な空間。特筆すべきはサウナ室のすぐ横に配置された水風呂で、水温は15度〜16度としっかり冷却されています。さらに、12階の半露天エリアには外気浴用の「ととのい椅子」が配置されており、海風を直接浴びながら外気浴に浸ることができます。地方の温浴特化型施設と比べても全く引けを取らない温浴体験が、宿泊料金の中にインクルードされているのです。
