長年『週刊少年サンデー』で連載を重ねる中で、毛利蘭を巡る伏線はファンの間で常に熱く議論されてきた。彼女は一見、事件に巻き込まれる心優しい女子高生として描かれがちだ。しかし、初期のストーリーから現在に至るまで、原作者の青山剛昌が忍ばせた数々の違和感や裏設定が存在する。
最大の謎の一つが、彼女が直感的に見抜く「コナンの正体」に関する伏線だ。かつて携帯電話のパスワードや、ふとした仕草から江戸川コナンと工藤新一を重ね合わせた場面は一度や二度ではない。疑惑を向けられるたびにコナンは周囲の協力を得て難を逃れてきたが、蘭の直感が一度として外れていないという事実は極めて重い。この鋭過ぎる直感こそが、最終局面に向けた最大の伏線であると見る専門家も多い。
また、彼女の名前の由来が推理小説の巨匠モーリス・ルブラン(アルセーヌ・ルパンの創始者)にあることは有名だが、作中での彼女の行動パターンには、名探偵を影で支える以上の「絶対的な庇護者」としての役割が与えられている。ファン必見の裏設定として、彼女の存在そのものが作中の闇を払う光として設計されているのだ。