酸性雨の脅威は、目に見えにくい速度で環境全体を侵食します。代表的な事例が森林被害と土壌酸性化です。土壌が過度に酸性化すると、植物の根に有害なアルミニウムイオンが溶け出し、樹木が水分やミネラルを吸い上げられなくなります。その結果、屋久島や白神山地などの原生林、あるいは日光のスギ並木などでも樹木の立ち枯れや衰退現象が報告されてきました。
都市インフラや歴史的遺産への打撃も深刻です。大理石や銅、コンクリート構造物は酸に弱く、屋外の彫刻や歴史的建造物が溶け出す被害が各地で発生しています。これに対しては建築物や重要文化財を保護する特殊コーティング剤の塗布や、定期的な中和洗浄といった保存工学的な対策が施されています。
人体への直接的な健康影響としては、強酸性の霧やエアロゾルを吸い込むことによる呼吸器系への刺激、さらには酸性化した水質によって配管から重金属が溶け出す二次被害などが懸念されており、環境衛生面での継続的な監視が求められています。
