美味しさだけでなく、現代の健康志向にも合致する優れた栄養プロファイルを持つ点も見逃せません。
日本食品標準成分表などの分析データに基づくと、じゃこ天1枚（約45〜50g）あたりのエネルギーは約70〜80kcal、タンパク質は約6〜8g、炭水化物は約2〜4gと、非常に高タンパク・低糖質な設計になっています。原料となる魚のすり身が主成分であり、つなぎの澱粉使用量が控えめな高品質品ほど糖質は低くなります。
さらに特筆すべきは、小魚を丸ごと粉砕・混合して作られることによるカルシウムの豊富さです。1枚あたり約100〜150mg前後のカルシウムを含み、成長期のお子様のおやつや、骨密度が気になるシニア世代の栄養補給としても非常に合理的です。また、青魚特有の不飽和脂肪酸であるEPA（エイコサペンタエン酸）やDHA（ドコサヘキサエン酸）も自然な形で摂取できます。
