旅行計画時に見落としがちなのが、登別マリンパークニクスのアクセス・駐車場に関する動線です。車でアクセスする場合、道央自動車道「登別東IC」を降りて約5分と非常にわかりやすいルートですが、登別温泉街（山側）とは車で約15分（約8km）ほど離れた海沿いの平地に位置しています。「温泉街のど真ん中にある」と勘違いしていると旅程にズレが生じるため注意が必要です。
駐車場は約750台を収容可能な大型パーキングが完備されており、普通車の駐車料金は1日500円（定額）です。敷地が広大であるため、メインゲート近くに駐車したい場合は午前中の早い到着が有利です。
また、ニクス城内のショップ「アトランティス」では限定の海洋生物グッズや北海道銘菓が揃いますが、閉館間際の16時前後はレジが混み合います。お土産選びはショーの合間の空き時間に済ませておくのがスマートな立ち回り方です。
