事態を重く見た公益財団法人日本高等学校野球連盟は、学校側からの報告を受けて即座に事実関係のヒアリングを実施した。学生野球憲章に照らし合わせ、不適切行為の有無や組織的な隠蔽がなかったかを精査する体制が整えられた。過去の事例を見ても、連盟は体罰やハラスメント、生徒間の不祥事に対して厳罰で臨む姿勢を強めている。
日本の高校野球を統轄する組織として、高野連は単なる処罰にとどまらず、加盟校全体に対するコンプライアンス遵守の再徹底を求めた。公式な見解が出される過程において、大会への出場可否や関係者の処遇を巡り、連盟本部と地域連盟との間でも慎重な議論が重ねられた経緯がある。