生徒一人ひとりの適性と夢に応える柔軟なシステムとして、敬愛高校のコース特徴は非常に洗練されています。高校段階では主に以下のような特色あるクラス編成が敷かれています。
最上位に君臨する九大医進コースは、九州大学をはじめとする難関国公立大学や国公立・私立の医学部医学科現役合格を本気で狙う精鋭クラスです。ハイレベルな先取り学習と徹底した個別添削、放課後の特別講座が日常的に行われており、予備校に通わずとも大学受験を突破できる学力を養成します。
国公立大学および難関私立大学の文理両学部を目指す特進コースでは、基礎から応用へのシームレスな移行と、探究型学習を通じた論理的思考力の育成に重きが置かれています。文武両道を実践する生徒も多く、活気ある学習コミュニティが形成されているのが特徴です。
さらに、多様な進路選択と自己実現を支援する進学コースや、ネイティブ教員によるオールイングリッシュ授業や海外研修を組み込んだグローバル教育も充実。ICT教育の推進スピードも早く、全校生徒がタブレット端末を活用して授業や課題提出、進路情報の共有を日常的に行うなど、次世代型の学びが定着しています。