では、なぜ日本列島ではこれほどまでにA型が定着したのでしょうか。日本人にA型が多い理由は、古代における集団の移動と感染症の淘汰圧という2つの歴史的ファクターから読み解くことができます。
定説とされているのが、縄文時代から弥生時代にかけての民族移動です。先住の縄文人はO型やB型が比較的多かったと推測されていますが、大陸から高度な水稲農耕技術を携えて渡来した弥生人集団にはA型遺伝子を持つ人々が多く含まれていました。温暖湿潤な日本列島で稲作が急速に普及するプロセスとともに、農耕集団の遺伝子が列島全体へと広がっていったと考えられています。
もう一つの要因が、集団生活に伴う感染症との戦いです。農耕の定着によって人々が密集して暮らすようになると、天然痘やコレラといった感染症の流行が頻発するようになりました。近年の分子生物学的な研究により、血液型抗原の違いによって特定の病原体に対する感受性（かかりやすさや重症化リスク）が異なることが判明しています。かつて列島を襲った疫病の波を生き抜く過程で、A型の形質が環境適応として有利に働いた結果、現在の40%という高いシェアが形成されたと分析されています。
