大手予備校（河合塾など）が公表している2026年度入試に向けた最新データによると、岐阜医療科学大学の偏差値は37.5〜47.5の範囲に位置しています。学部・学科ごとの具体的なボーダーラインと共通テスト得点率の目安は以下の通りです。
保健科学部において、特に伝統と実績を誇る放射線技術学科の難易度は偏差値45.0〜47.5、共通テスト得点率60%前後と、学内でも上位の人気を誇ります。また、臨床検査学科は偏差値42.5〜45.0（共テ得点率55〜58%）、看護学部の偏差値は40.0〜42.5（共テ得点率52〜55%）で安定しています。6年制の薬学部の偏差値は37.5〜40.0（共テ得点率50〜54%）となっており、中堅医療系私立大学としての確固たるポジションを築いています。
見かけ上の偏差値だけで判断すると中堅クラスに見えますが、医療系入試特有の理科・数学の必須科目や小論文・面接が課されるため、数字以上の基礎学力と対策が求められます。
