水やりの頻度や必要水量は、植物の種類によって大きく異なる。室内で育てる観葉植物と、屋外のベランダや畑で育てる家庭菜園では、ペットボトル自動給水器の設計を変える必要がある。
ベランダ菜園のトマトやキュウリなどの野菜類は、夏場の蒸散量が非常に多く、500mlのボトルでは半日も持たないことがある。そのため2リットル以上の大型ボトルを複数設置するのが基本だ。一方で、多肉植物や一部の観葉植物は水の与えすぎによる根腐れが懸念される。経験豊富な園芸家によると、「鉢の大きさと葉の表面積に合わせて紐の太さや挿し込む深さを変えることが、失敗を防ぐ最大のコツ」だという。
