本丸跡に鎮座する眞田神社は、真田氏、仙石氏、松平氏という歴代上田城主を祀る神社です。ここで授与される眞田神社の御朱印とご利益には、他では見られない強い信仰が集まっています。
最大の注目は、全国の受験生や資格試験挑戦者がこぞって買い求める真田神社落ちない絵馬の真相です。徳川の大軍を2度も退け、落城することがなかった上田城の不抜の歴史から、「決して落ちない城＝志望校に落ちない・運気が落ちない」という勝運・不落の御利益へと結びつきました。本丸境内にある「真田井戸」は城外の砦へ通じる抜け穴だったという伝説があり、困難から抜け出す知恵と突破力を授かる象徴とされています。
また、眞田神社で頒布される御朱印は、真田家の家紋である「六文銭」や「結び雁金」をあしらったものに加え、桜まつり限定・紅葉まつり限定の切り絵御朱印など多彩に展開されています。御朱印帳に直書きを希望する場合は、混雑する土日祝日の午前中を狙うのがスムーズです。
