本作の核心となるのが、チベット奥地のチョーミン渓谷で極秘裏に建造されていた4隻の超巨大船舶「方舟（アーク）」の存在です。全高数百メートルにおよぶこの巨大シェルターは、最先端の工学技術と中国の突貫工事によって建造されていました。しかし、その乗船資格には過酷な資本主義の選民思想が色濃く反映されていました。
方舟の建造資金を調達するため、G8を中心とする首脳陣は世界の大富豪たちに対し、1人あたり10億ユーロ（当時の日本円換算で約1,300億円）という天文学的な価格で乗船チケットを秘密裏に販売していたのです。残りの枠は、各分野の優秀な遺伝子を持つ科学者、芸術遺産、動植物の標本、そして国家首脳とその近親者に限られていました。
世界中の一般大衆は何の事実も知らされないまま日常を奪われ、暴動を防ぐという名目のもとで「無知のまま見捨てられる」運命を課されました。現場責任者である大統領首席補佐官カール・アンハイザーに象徴される徹底した合理主義と、エイドリアン博士が掲げる人道主義の対立は、本作における最大の倫理的テーマとなっています。
