砥鹿神社は、人生の節目における各種ご祈祷の場としても地域で最も頼りにされています。厄年の厄払いをはじめ、初宮参り（お宮参り）、七五三詣、車のお祓いなど、毎日厳粛な神事が執り行われています。
ご祈祷の受付体制と基本情報は以下の通りです。
- 受付場所：里宮 祈祷受付所（拝殿右手）
- 受付時間：午前9時00分 〜 午後3時30分（年中無休・事前予約不要で当日受付）
- ご祈祷初穂料：個人祈祷 5,000円／7,000円／10,000円〜（神楽奉納や授与品の内容により変動）
- 所要時間：受付完了後、概ね20分〜30分程度
特に七五三シーズン（10月中旬〜11月下旬）や初春の厄除けシーズンは多くの家族連れで賑わいますが、境内が広々としているため、ゆったりとした心持ちで祈祷を受けられます。境内には写真映えする朱塗りの太鼓橋や日本庭園があり、記念撮影スポットにも事欠きません。
