視聴者を戦慄させる『もぺもぺ』ですが、その意味やストーリー性についてはネット上で無数の考察が交わされてきました。タイトルの「もぺもぺ」という不思議な響きについて、有力視されている説の一つが英語の「mope（ふさぎ込む、鬱ぐ）」から派生した造語という見方です。幼児語のような無邪気な響きの裏に、重度の精神的抑うつ状態を隠蔽しているという解釈です。
また、映像全体が「違法薬物による重度のバッドトリップ」や「精神疾患による幻覚・解離症状」を具現化したものではないかという考察も根強く支持されています。最初は色鮮やかで幸せに満ちた世界（多幸感）が、ある瞬間を境に制御不能な悪夢（幻覚・パラノイア）へと転落していく様は、薬物中毒の心理的恐怖と酷似しています。
さらに映像を1コマずつ解析すると、隠されたテキストや逆再生ギミックが仕込まれていることが判明しています。音声を逆再生すると特定の不穏なフレーズのように聞こえる箇所や、一瞬だけ表示される「たすけて」とも読み取れる文字列など、制作者のOptie氏とLeaF氏が散りばめた暗号のような仕掛けが、考察班の探求心を刺激し続けています。
