爽快なポップソングでありながら、なぜ『ミスター・ブルー・スカイ』はこれほどまでに奥深く、聴く者を惹きつけてやまないのでしょうか。その秘密は、緻密に計算されたピアノコード進行と、ビートルズからの影響を昇華させた転調パターン分析にあります。
楽曲の基本キーはFメジャーです。ヴァース（Aメロ）のコード進行を標準的な表記で追ってみましょう。
【Aメロ（ヴァース）基本コード進行】
| F | Fmaj7 | Fm7 | D7 |
| Gm | Gm7 | C | F C |
ここで注目すべきは、冒頭の「F → Fmaj7 → Fm7」という半音下降のライン・クリシェです。ルート音のFを保ちながら、内声が「ファ（F）→ ミ（E）→ ミ♭（E♭）」へと滑らかに下降していきます。Fm7という同主短調からの借用和音（モーダル・インターチェンジ）が挟まることで、ただ明るいだけではない、一瞬の翳りやノスタルジーが演出されます。
さらにその直後、本来のダイアトニックコードであるDmではなく、セカンダリー・ドミナントであるD7が力強く鳴り響きます。これが次のGm（2度マイナー）への強い推進力を生み出し、Gm → Gm7 → C7というジャズや王道ポップスでおなじみの「ツー・ファイブ・ワン」を経てトニックのFへと鮮やかに着地します。
一方、コーラス（サビ）ではコードの動きが一変し、力強いストレートな進行へと舵を切ります。
【Bメロ・コーラス基本コード進行】
| F | C/E | Dm | C |
| B♭ | F/A | Gm | C |
ベースラインが「ファ → ミ → レ → ド → シ♭ → ラ → ソ → ド」と美しいダイアトニックスケールを描いて順次下降（ステップワイズ・ベース）していきます。このベースの動きこそが、分厚いコーラスと合わさった際に圧倒的な疾走感とシンフォニックな広がりを生み出す構造的コアとなっています。
楽曲終盤、突如としてテンポ感が変わり、ヴォコーダーを通した「Mr. Blue Sky...」の声とともにシンフォニックなアウトロへとなだれ込むセクションでは、E♭メジャーやB♭メジャーといったフラット系コードが多用され、壮大な映画音楽のような全音下げの転調感覚を味わわせてくれます。
