来園計画を立てる際、もっとも注意しなければならないのが市川市動植物園ミニ鉄道雨天運行のシビアな基準です。結論から言うと、ミニ鉄道は屋外を鉄製レールで走行する構造上、雨が降り始めるとスリップによる追突や脱線事故を防止するため、小雨であっても即座に運行見合わせ（運休）となります。
「小雨程度なら動いているだろう」と油断して現地を訪れると、乗り場に運休の看板が掲げられていて途方に暮れるケースが後を絶ちません。現場の運行管理基準では、降雨中だけでなく「レールの濡れ具合」が厳格にチェックされています。雨が止んだ後であっても、濡れた線路の水分が蒸発し、安全点検の試運転を終えるまでは運行が再開されない点には留意してください。
当日の市川市動植物園ミニ鉄道運行状況や市川市動植物園ミニ鉄道運休再開情報については、天候が不安定な日には園内放送で随時アナウンスされます。また、市川市動植物園の公式ウェブサイトや公式SNS（X等）でも急な運休・再開の状況が告知される体制が整っています。怪しい空模様の日は、入園前に園の公式アナウンスや電話窓口で稼働状況を事前に確認しておくのが確実です。
