三木総合運動公園へアクセスする際、車を利用する場合は山陽自動車道の三木小野ICから約10分、中国自動車道の吉川ICからもスムーズにアクセスできる好立地です。施設全体で数百台規模を収容できる大型駐車場が完備されており、駐車料金は原則無料となっています。
一方で、大型大会やフェスティバルが重なる週末は、午前8時前後から中央駐車場を中心に満車となる傾向があります。当日の混雑状況をリアルタイムに把握したい場合は、公園管理事務所への電話確認や、大会主催団体の公式SNS・ウェブサイトにおける駐車規制アナウンスをチェックするのが最も確実です。
公共交通機関を利用する場合、神戸電鉄「三木上の丸駅」や「恵比須駅」などから路線バス（神姫バス・みっきぃバス）を利用するルートが基本です。ただし、平日に比べて土日祝日のバス運行本数は限定的となるため、最寄り駅からの発車時刻と帰りの便をあらかじめメモしておくことがトラブル回避の鉄則です。
