ダイアップ坐剤を使用すると、けいれんを予防する一方でいくつかの特徴的な副作用が現れます。最も代表的なものが「強い眠気」と「足元のふらつき」です。
脳の興奮を抑える作用があるため、投与後は半日から翌日にかけてウトウトと寝続けたり、歩かせようとすると千鳥足のように足元がおぼつかなくなったりします。これらは薬が正常に効いている証拠でもあり、過度に恐れる必要はありません。ただし、ふらついて家具の角に頭をぶつけたり階段から転落したりしないよう、保護者がしっかりと見守る必要があります。また、稀に興奮して不機嫌になったり幻覚のような言動を見せたりする「奇異反応」が出ることもありますが、多くは薬の効果が切れるとともに自然に消失します。
小児神経学会のガイドラインにおいて、ダイアップの投与基準は「熱性けいれんを2回以上反復した」「15分以上続く遷延性けいれんであった」「部分発作や24時間以内の群発があった」など、再発リスクが高い子どもに対して適用されます。熱性けいれん自体は脳の発達に伴って自然と起こりにくくなるため、ダイアップ坐剤の使用は一般的に4歳〜5歳頃（遅くとも就学前）までで終了となるケースがほとんどです。
