視聴者から番組宛てに寄せられる問い合わせの中でも、常に上位を占めていたのが「ジーンちゃんの犬種は何ですか？」という質問です。立ち耳と垂れ耳の中間のような愛嬌ある耳、白い毛並みに薄茶色（ベージュ）のぶち模様、そして小柄で俊敏な体つきから、愛犬家の間でも長年にわたり熱心な議論が交わされてきました。
カンテレ公式の基本設定において、ジーンちゃんは「世界中を旅する不思議な子犬」という位置付けのオリジナルキャラクターであり、特定の血統種を公式に明言した記録はありません。しかし、制作関係者の証言や動物造形デザインの観点から検証すると、極めて明確なモデル像が浮かび上がってきます。
最も有力視されているのが、イギリス原産の小型テリア犬種であるジャック・ラッセル・テリアです。好奇心旺盛で恐れを知らず、常に新しい刺激を求めて走り回るジャック・ラッセル・テリアの気質は、世界中へ単身飛び込んでいくジーンちゃんのキャラクター設定と完全に合致しています。また、ホワイトをベースにタン（茶色）が入る毛色パターンや、細身でありながら活動的なマズル（鼻先）の輪郭線も、同犬種の特徴を色濃く反映しています。一部では「キャバリアやビーグルとのミックスではないか」という見解もありましたが、旅番組のアクティブなアイコンとして、テリア系の躍動感がデザインのベースに選ばれたと見るのが自然です。
