大阪府立藤井寺高等学校の学力基準を示す偏差値はおよそ45〜47のレンジに収まります。大阪府内の公立高校全体で見るとちょうど中位グループに位置し、基礎学力をしっかりと身につけながら着実に高校生活を送りたい層から根強い支持を集めています。周辺の松原高校や長野高校、河南高校などと比較検討されるケースが多く、南河内エリアにおける標準的な進学選択肢の一つです。
校風は全体として大らかで落ち着きがあり、荒れた雰囲気を感じさせない穏やかさが特徴です。校風と男女比について現場の様子を取材すると、男女比はおおむね1対1の均衡を保っており、学年やクラスによって女子がわずかに上回る年がある程度です。生徒同士の距離感が近く、体育祭や文化祭などの学校行事ではクラス単位で結束して盛り上がるアットホームな土壌が受け継がれています。
ネット上の掲示板では「可もなく不可もない中堅校」と評される場面も見受けられますが、これは裏を返せば、極端なプレッシャーに晒されず、自らのペースで高校生活を設計できる余白があることを意味します。学力的に上位校を目指して惜しくも届かなかった生徒から、手堅く地元公立を選んだ生徒まで混在しているため、入学後の学習姿勢によってその後の立ち位置が大きく分かれます。