教育環境の特色として見落とせないのが、愛知中高の併設型一貫校としての特徴です。中学校からの内進生と高校からの高入生は、高校進学時に完全に混ざり合うのではなく、カリキュラムの進度差を埋めるため高校1年次は別編成を取るなど、きめ細かな配慮がなされています。内進生の高い学力刺激と、高入生が持ち込む新しい風が相互に良い影響を及ぼし合っており、「人間関係が固定化されにくい」というメリットを生み出しています。
また、同校の根本にあるのが愛知中学校・高等学校の宗教教育（曹洞宗）です。福井県の永平寺と横浜市の總持寺を両大本山とする禅宗の教えに基づき、「行学一体」「報恩感謝」を行動指針に掲げています。週に1度の「宗教」の時間や、年に数回行われる座禅会、仏教行事に対して、「宗教色が強すぎるのではないか」と懸念する声が入学前に聞かれることもあります。しかし、卒業生へのインタビュー調査では「朝の静座（黙想）で雑念を払い、集中力を高める習慣がついた」「受験期の極限状態でメンタルを整えるのに座禅が役立った」という肯定的な手記・述懐が大多数を占めています。
課外活動においても文武両道の精神が息づいており、愛知高等学校の部活動実績は目覚ましいものがあります。インターハイ常連の弓道部やハンドボール部、全国規模の大会で入賞歴を誇る水泳部や陸上競技部、さらにコンクールで金賞を受賞する吹奏楽部など、運動系・文化系を問わず活気にあふれています。
生活指導面に関する愛知中高の校則の口コミでは、「スマートフォンの校内使用制限」「頭髪や服装に関する定期的なチェック」が存在することから、ネット掲示板などでは「公立高校に比べると厳しい」と評されることがあります。しかし、保護者視点では「乱れがなく安心して子どもを預けられる規律正しい環境」と受け止められており、自由放任主義ではなく一定の秩序を重んじる家庭には非常にマッチする運用です。
