多くの人々が最も注視しているのが、京都小6男児行方不明事件における事件性と犯人の存在です。男児が姿を消した直後から、警察は延べ数百人規模の捜査員を動員し、通学路、河川敷、山林、空き家などをくまなく捜索してきました。しかし、明確な遺留品や争った形跡が発見されていないことから、捜査本部は「自発的な移動」「不慮の事故」「第三者による連れ去り（誘拐）」のあらゆる可能性を排除せずに慎重な捜査を進めています。
報道各社の取材や京都の行方不明事件に関する警察発表を総合すると、現時点で「特定の被疑者（犯人）」が割り出されたという確定情報は公表されていません。にもかかわらず、ネット検索で「京都小6男児行方不明 犯人」というワードが上位に浮上するのは、手掛かりの少なさゆえに「誰かに連れ去られたに違いない」という第三者関与を疑う心理が強いためです。
警察関係者の証言によると、現場周辺における京都の男児行方不明事案における誘拐の可能性については、不審車両のNシステム通過記録や近隣住宅の防犯カメラ映像、ドライブレコーダーのデータ解析が徹底的に行われています。わずかな時間差で足取りが途絶えている点こそが、京都の小6男児失踪事件における真相究明の最大の壁となっています。
