私立中学への進学で最もシビアな検討事項となるのが、6年間の学費と追加費用の総額です。文教大学付属中学校の初年度学費は、入学金（約25万円）、授業料（年額約45万円）、施設設備費、PTA会費、積立金等を合わせて初年度総額およそ105万円〜115万円前後となります。
東京都内の私立共学中高一貫校の平均初年度費用が約100万〜120万円であることを考慮すると、標準的かつ良心的な設定です。さらに注目すべきは「学費に含まれる教育付加価値」の高さです。
現場取材や学校関係者の証言によると、同校では長期休暇中の特別講習や放課後補習、定期試験前のフォローアップ体制が極めて体系化されています。中学生の間は外部の進学塾や補習塾に通わずに学校のカリキュラムだけで十分な基礎学力を固められる体制が構築されており、家計における「隠れ教育費（通塾代）」を大幅に抑えられる点が多くの保護者から支持を集めています。
