ネット上では高齢芸能人ゆえに「萩本欽一 病気」「健康状態」といった検索ワードが定期的に浮上します。現場の取材記録や公式発表を確認すると、過去に脱水症状による緊急搬送や体調不良で一時休養した経緯はあるものの、重大な持病を抱えて寝たきりになっているという事実は一切ありません。
舞台上での転倒を防ぐためのウォーキングや、規則正しい生活リズムの維持など、健康管理には人一倍気を配っています。
プライベートの側面では、下積み時代を支え続けた最愛の妻・澄子さんの存在が有名です。浅草のストリップ劇場時代からの付き合いで、「おっ母(かあ)」と呼んで生涯愛し抜いた澄子さんとは2020年に死別しました。大きな悲しみを抱えながらも、3人の息子たちをはじめとする家族や愛弟子たちの支えを受け、前を向き続けています。