コメダ珈琲店を利用する上で最大の目玉といえば、開店から午前11時まで提供される名物のモーニングサービスです。ドリンクを1杯注文するだけで、焼きたてのトースト（またはローブパン）に定番ゆで玉子、手作りたまごペースト、小倉あんのいずれかが無料でセットになるシステムは、2026年の現在もモーニング文化の象徴として親しまれています。
コメダ珈琲店 長崎時津店のモーニングにおける最大の関心事は、朝の混雑ピークが何時に訪れるのかという点です。現地の動向を追うと、平日は近隣のシニア層やビジネスパーソンが中心で、午前8時台から9時台にかけて程よい稼働率（約60〜70%）を保ち、待たずに着席できる場面が目立ちます。
一方で注意が必要なのが土日・祝日の午前中。コメダ珈琲店 長崎時津店の混雑状況は、午前8時30分を過ぎると一変します。ファミリー層や若年層のグループが一気に押し寄せ、エントランスの発券機には常時5組〜10組以上の待ち列が発生。待ち時間が最大で30分から45分程度に達することも珍しくありません。
ゆったりと朝の時間を堪能したいのであれば、開店直後の朝7:00から8:00までの時間帯を狙うのがベストです。朝日が差し込む静かなボックス席で、ゆったりとブレンドコーヒーとモーニングを楽しめます。逆に10時30分以降は、モーニング終了直前の駆け込み需要と、11時30分から始まるコメダ珈琲の時津ランチ（昼コメプレート）を狙う層が重なるため、店内の慌ただしさが増す傾向にあります。
