参拝にあたって押さえておきたいのが、2026年現在の御朱印授与システムだ。波除神社では通常デザインに加え、季節の行事や月替わり、毎月7日に授与される「七福神御朱印」など多彩な限定御朱印を用意している。社務所の受付時間は午前9時から午後4時30分までとなっており、休日や午前中の早い時間帯はスムーズな対応を期待できる。
限定御朱印の授与を受ける際は、初穂料を用意し、参拝を済ませた後に社務所へ向かうのがマナーだ。特に獅子祭の期間中や正月の初詣シーズンには長蛇の列ができるため、時間に余裕を持ったスケジュール調整をおすすめしたい。