お菓子以外の記念品として、海響館限定グッズの充実ぶりは国内水族館でもトップクラスです。特に注目を集めているのが、日本最大級のペンギン展示「ペンギン村」に直結したオリジナルグッズ展開です。
海響館ペンギンぬいぐるみは、単なるデフォルメ商品にとどまりません。現場の飼育員が骨格や羽毛の生え方、ヒナ特有の綿羽の質感まで細かくチェックして制作された限定モデルが存在します。フンボルトペンギンやマカロニペンギンなど、種類ごとの微妙なくちばしの形状差まで再現されたアイテムは、コレクターの間でも「再現度の高さが異次元」と高く評価されています。
また、海響館ふぐグッズも見逃せません。ぷっくりと膨らんだトラフグの感触を再現した「もちもちふぐクッション」や、本物のフグ皮のようなシボ加工を施したパスケース、水族館のロゴがあしらわれた限定文房具など、ユーモアと実用性を兼ね備えたアイテムが棚を埋め尽くしています。現地を訪れた証として、自分用や親しい人へのギフトに選ばれる傾向が顕著です。