『にゃんこ大戦争』が定期的に開催するアニメやゲームとの大型コラボレーションも、話題の起爆剤となってきました。過去に開催された主なコラボタイトルの顔ぶれを見ても、その豪華さは折り紙付きです。
『エヴァンゲリオン』のアスカやレイ、『Fate/stay night [Heaven's Feel]』のセイバーや間桐桜、『魔法少女まどか☆マギカ』の魔法少女たちなど、名立たるヒロインたちが独自の等身とアニメーションでゲーム内に実装されてきました。原作のプロポーションや魅力をリスペクトしつつ、攻撃アニメーションの躍動感を徹底再現したドット絵は、コラボが復刻されるたびにSNS上で大きな盛り上がりを見せます。