英科学誌『ネイチャー』や米科学誌『セル』の元編集者や世界の発生生物学者たちは、笹井氏の手腕を「生物学を幾何学と物理学のレベルにまで昇華させた天才」と称賛しました。
当時、再生医療の主流は「特定の細胞（心筋細胞や神経細胞など）をシート状にして移植する」という二次元的なアプローチでした。しかし、ヒトの臓器は精密な三次元構造を持たなければ本来の機能を果たせません。笹井氏が提唱した自律組織化 脳杯形成のメカニズムは、まさにその限界を突破する決定打でした。
世界各国の研究者コミュニティや学術機関の記録によると、笹井氏の研究室が発表した論文群は数千回以上にわたり引用され、現代の「オルガノイド生物学」という一大潮流を拓く直接的な源流となりました。ノーベル賞受賞者を含む国内外の重鎮たちが、笹井氏を「将来のノーベル賞候補筆頭」と名指しで評していた理由は、単なる技術開発にとどまらない、生命科学の基本原理そのものを塗り替える発見だったからです。
