中古買取の現場で最も問い合わせが多く、査定後に落胆の声が上がりやすいのが「付属品の欠品」と「本体の不具合」です。ゲオの査定マニュアルは全国統一の厳格な減点方式を採用しており、欠品項目ごとに容赦なくマイナス評価が加算されます。
「箱・説明書なし」の場合、機種にもよりますがおよそ1,500円から3,000円前後の減額が執行されます。ゲオの店舗陳列において、箱付き商品は「中古美品」としてショーケース内の最前列に並びますが、本体のみの商品は袋詰めされてワゴンや吊り下げ棚に配置されるため、販売想定価格そのものが一段階下がるためです。
一方、注意が必要なのが充電器の存在です。初期型3DSには純正ACアダプターが同梱されていましたが、New 3DSやNew 3DS LLは任天堂の意向により発売当初から「充電器別売り」でした。そのため、Newシリーズに関しては充電器が付属していなくても欠品減額の対象にはなりません。しかし初期型モデルを持ち込む際、純正充電アダプターがないと300円から800円程度の減額を受けることになります。
さらに深刻なのが動作不良や物理破損を抱えた「ジャンク品」の扱いです。ゲオは自社で大規模なリペア専門工場を抱えるメーカー系専門業者とは異なり、店頭で動作確認が取れない個体をジャンク品として再商品化するコストを極度に嫌います。ボタンが反応しない、液晶に著しい黒ずみや液漏れがある、充電端子がぐらついている、タッチペンが欠損しているといった場合、査定額は一気に100円から数百円の「まとめ買取価格」まで急落します。最悪の場合、バッテリーの膨張によって背面カバーが浮いている個体は、発火リスクと店頭保管の安全性基準から「買取不可（引き取り拒絶）」となるケースも珍しくありません。
