JR東日本の路線だけでなく、東京メトロ、都営地下鉄、東急電鉄、小田急電鉄といった私鉄各社との連絡定期券も、モバイルSuica1台にまとめて発行することができます。例えば「JR線 ＋ 東京メトロ線」や「東急線 ＋ JR線」といった複数社をまたぐルートでも、発駅または着駅、あるいは経由駅にJR東日本の区間が含まれていれば、1枚の定期券として完結します。
ただし、連絡定期券には発券可能な「接続駅」や「社線数（最大2社〜3社まで）」の規定があり、極端に迂回するルートや一部の特殊な連絡運輸協定外の区間はアプリ上で経路候補に出てこない場合があります。経路検索で目的のルートが表示されない場合は、経由駅の指定を変えて再検索するか、区間によっては私鉄側が提供する「モバイルPASMO」の利用を検討するのが賢明です。
決済に使用するクレジットカードについては、VISA、Mastercard、JCB、American Expressなど主要ブランドに幅広く対応しています。家族カードや一部のデビットカード・プリペイドカードでも3Dセキュアに対応していれば登録可能ですが、定期券は高額決済になりやすいため、限度額の設定にも余裕を持たせておきましょう。
