JR線（山手線・中央線・埼京線など）を利用して訪れる場合、地下通路を通るよりも地上ルートを選択した方が、結果として早く劇場へ到着できるケースがほとんどです。その理由は、新宿駅地下の複雑な構造と歩行者密度にあります。
JR利用時における迷わず行ける最短ルートの理由は、改札選びにあります。結論から言えば、目指すべきは「東南口」です。
JR新宿駅東南口ルートの手順は極めてシンプルです。東南口改札を出ると目の前に大きな広場があり、そこから下りエスカレーター（または大階段）で地上広場へ下ります。そのまま正面の「Flags（フラッグス）」ビルを右手に見ながら、甲州街道の高架に沿って東方向（新宿御苑方向）へまっすぐ直進します。途中、大きな交差点（新宿四丁目交差点）を1つ渡ると、左手に「新宿マルイアネックス」の重厚なエントランスが見えてきます。所要時間は実測で約4分30秒〜5分です。
一方、JR新宿駅南口からの行き方を選ぶ場合は注意が必要です。南口改札を出て左折し、甲州街道の緩やかな坂を下っていくルートになりますが、バスタ新宿前やニュウマン新宿周辺は待ち合わせや外国人観光客で終日混雑しています。歩行速度が落ちやすいため、東南口ルートよりも1〜2分余計にかかる傾向があります。「改札を出たら東南口」を徹底することが、上映前のタイムロスを防ぐ鉄則です。
