物語を正しく読み解く上で欠かせないのが、三葉と瀧の間に横たわる「3年間の時間差」です。岐阜県の山深き架空の町・糸守町に暮らす女子高生だった宮水三葉は1997年12月9日生まれ。彼女が瀧と入れ替わっていた時期は2013年秋（高校2年生・17歳）でした。一方、東京に暮らす立花瀧が入れ替わりを体験していたのは2016年（高校2年生・17歳）であり、三葉は瀧よりも実年齢で3歳年上という構造になっています。
この時間差のズレこそが、物語中盤の最大の衝撃展開を生み出しました。瀧に会うため単身東京を訪れた2013年の三葉は、まだ自分を知らない中学生（14歳）の瀧と遭遇し、傷心の中で自身の組紐（髪飾り）を託します。この出会いによって渡された組紐が、3年後の瀧の腕に巻かれ、時間軸を結び直す決定的なキーアイテムとなりました。
三葉の声を担当した上白石萌音の繊細な演技も、この複雑な心理描写を完璧に支えています。思春期特有の閉塞感、入れ替わり時の少年らしさ、そして終盤の鬼気迫る覚悟を演じ分けた声の説得力は、オーディション時に新海誠監督が「声そのものにドラマがある」と絶賛した通りの輝きを放ちました。
