『ビリー・ジーン』の生々しい描写は、単なるフィクションの枠に収まりません。この楽曲の背景には、マイケルが青年期に直面した隠し子騒動の真相と、実在したビリージーンモデル女性の影が存在します。
1988年に出版されたマイケルの自伝『Moonwalk（ムーンウォーク）』において、本人は次のように述懐しています。「ビリー・ジーンという特定の女性が一人だけ実在したわけではない。僕や兄たちが活動する中で、いつも周りを取り囲んでいたグルーピー（熱狂的な追っかけファン）たちを複合させたキャラクターなんだ」。
しかし、楽曲の核となるプロットには、極めて具体的なストーカー事件が影を落としています。当時、マイケルの邸宅にはある女性ファンから大量の手紙が届いていました。その内容は次第に常軌を逸し、「私はあなたの子ども（双子）を産んだ」「あなたは実の父親だ」と一方的に主張するようになったのです。さらに手紙はエスカレートし、「ある指定の日に指定の時間、銃で自ら命を絶ってほしい。私も子どもと一緒に命を絶ち、天国で結ばれよう」という戦慄の内容まで送りつけられていました。
マイケルはこの手紙に深い恐怖を覚え、自宅の部屋にこもり、精神的に大きな打撃を受けました。後日、この女性は精神医療施設に収容されることとなりますが、名声の代償としてプライベートを侵食される恐怖は、マイケルの心に強烈なトラウマとして刻まれました。「嘘が真実にされてしまう（the lie becomes the truth）」という歌詞の警句は、現実の被害から絞り出された魂の叫びだったのです。
