大分岡病院の最大の強みの一つが、24時間365日体制で稼働する救急外来です。大分市東部だけでなく、近隣の佐伯市や臼杵市方面からの救急搬送も受け入れており、重症急性疾患に対する初期診断と緊急手術に迅速に対応できる医療機器（CT、MRI、血管造影装置など）と当直体制を常時維持しています。
さらに、同院の代名詞とも言えるのが大分岡病院の整形外科です。骨折などの外傷治療はもちろん、変形性関節症に対する人工関節置換術、脊椎・脊髄疾患、スポーツ外傷など、高度な専門技術を要する手術実績が豊富に蓄積されています。
手術後のリハビリテーション環境も充実しており、理学療法士・作業療法士・言語聴覚士による集中的な訓練体制が整備されています。早期離床から自宅復帰・社会復帰までを段階的にサポートするプログラムが組まれており、高齢患者のADL（日常生活動作）維持にも大きな成果を上げています。
