アルプス市場のもうひとつの名物が、屋外スペースに広大に展開されている「花・苗木」の販売エリアです。松本平の気候に適した野菜の苗や果樹の苗木、季節を彩る草花や鉢植えが圧倒的なスケールで陳列されています。
ホームセンター等と比較しても価格が非常にリーズナブルであるだけでなく、信州の冷涼な気候を熟知した地元生産者が育てた苗のため、購入後の根付きが非常に良いと評判です。春の植え付けシーズンには、家庭菜園を楽しむ愛好家やプロの農家が資材や苗を求めて早朝から詰めかけます。季節ごとの植え替え時期に訪れれば、専門知識を持つスタッフや生産者から直に栽培のアドバイスを受けることも可能です。