アフレコとアテレコの最大の違いは、「何の映像に対して音声を収録するか」という対象と、その言葉が生まれた「語源の成り立ち」にあります。
アフレコは、英語の「After Recording（アフター・レコーディング）」を短縮した和製英語です。撮影や作画が完了した映像（あるいは線画や絵コンテのテスト映像）を見ながら、タイミングを合わせてセリフや効果音、音楽を後から追加する作業全般を指します。日本のアニメーション制作における音声収録の標準形式として定着しています。
一方のアテレコは、「映像の口の動き（リップシンク）に日本語のセリフを『当てる』レコーディング」という日本語の俗称から生まれた造語です。昭和30年代、海外から輸入された映画やドラマをテレビ放送する際、原語を話す俳優の口元に日本語の声を当てはめた作業が発祥とされています。そのため、業界の厳密な定義において、アテレコは「洋画や海外ドラマの日本語吹き替え」を指す言葉として発展してきました。
現在では両者を同義として扱うケースも見られますが、アニメ業界・音響制作会社の現場では「アニメはアフレコ」「外画（洋画吹き替え）はアテレコ・吹き替え」と明確に区分されてきた経緯があります。
