『月とオオカミちゃんには騙されない』の感情移入度を極限まで高めた要因として、計算され尽くした音楽演出が挙げられます。
主題歌にはあいみょんの「さよならの今日に」が起用されました。疾走感の中に哀愁を帯びたメロディと、後戻りできない青春の刹那を描いた歌詞は、期限付きのアトリエ作業や恋のタイムリミットと完璧にシンクロしていました。
そして、名場面の数々を彩った挿入歌がBTSの「Let Go」です。「手放すことの美しさと痛み」を歌ったこの楽曲は、オオカミちゃんとして正体を隠し続けなければならない女子の葛藤や、赤い風船を手放す告白シーンで印象的に流れ、視聴者の涙腺を強く刺激しました。音楽と映像が見事に融合した演出クオリティの高さは、本作を単なる恋愛バラエティから至極の青春群像劇へと昇華させました。