京大農学部前を行き交う交通の主役は、何と言っても京都市営バスと京都バスです。市バスの停留所は今出川通を挟んで東西に設置されており、京都市内の主要拠点を結ぶ複数の基幹系統が乗り入れています。
京都市交通局が公開する京都市バス運行情報および現行ダイヤによれば、中心となるのは京都駅前と四条河原町、錦林車庫を結ぶ7号系統や、銀閣寺方面と京都駅を繋ぐ17号系統、そして今出川通・東大路通を循環して西陣や百万遍、祇園方面を網羅する203号系統です。昼間時間帯でも数分から十数分間隔でバスが発着しており、乗り換えなしで主要繁華街へアクセスできる利便性を誇ります。
一方で、鉄道の最寄り駅である京阪電気鉄道・叡山電鉄の出町柳駅からのアクセス経緯を辿ると、現地までは約1.1km、成人男性の足でも徒歩約15分を要します。また叡電の元田中駅からも約1.1km（徒歩約14分）の距離があり、「完全な駅前立地」ではありません。この絶妙な距離感こそが、観光客の過剰な流入を適度に防ぎ、落ち着いた文教地区の佇まいを維持している最大の要因となっています。
