対戦環境におけるメガリザードンの真の恐ろしさは、選出画面の段階でXかYかを100%判別できない点にあります。相手側からすれば、特殊受けを出せばXの物理技で粉砕され、物理受けを出せばYの晴れ特殊砲撃で焼き払われるという悪夢の択を迫られます。
【メガリザードンX：りゅうのまい全抜き型】
・性格：いじっぱり または ようき
・努力値配分：攻撃252 / 素早さ252 / HP4
・確定技：りゅうのまい / フレアドライブ / げきりん（または ドラゴンクロー）
・選択技：じしん / かみなりパンチ / はねやすめ
起点を作って「りゅうのまい」を1度積めば、特性「かたいツメ」と相まって多くのポケモンを一撃で突破します。環境によっては耐久に厚く振り、「おにび」と「はねやすめ」で粘り強く戦う型も強力な選択肢です。
【メガリザードンY：超火力特殊アタッカー型】
・性格：ひかえめ または おくびょう
・努力値配分：特攻252 / 素早さ252 / 防御4
・確定技：かえんほうしゃ（または だいもんじ / オーバーヒート） / ソーラービーム
・選択技：エアスラッシュ / きあいだま / りゅうのはどう / はねやすめ / まもる
登場した瞬間に天候を晴らし、高火力を押し付けます。耐久無振りのガブリアス程度であれば、晴れ補正の「オーバーヒート」で確定1発圏内に入れるほどの狂気的な破壊力を持ちます。
