例年正月三が日には約30万人から40万人もの参拝客が訪れる加藤神社。初詣期間中は境内周辺が非常に混雑するため、計画的な参拝が欠かせません。大晦日から元日にかけては終夜参拝が可能ですが、元日の午前10時から午後3時頃までが混雑のピークとなります。混雑を避ける場合は、早朝または夕方16時以降の時間帯を狙うのが賢明です。
通常の境内開放時間は午前6時から午後5時30分まで(授与所は8:30〜17:00)となっており、朝の澄んだ空気の中での参拝は清々しさに満ちています。
アクセス面では、熊本城内にある有料駐車場(三の丸第1・第2駐車場や二の丸駐車場)を利用するのが一般的です。ただし、土日祝日やイベント開催時は満車となるケースが多いため、熊本市電「熊本城・市役所前」電停や「花畑町」電停から徒歩で城内の景観を楽しみながら向かうルートが最も確実で快適な移動手段となります。