現代の長距離フェリーは、かつての「大部屋で雑魚寝する貨物主体の船」というイメージを完全に覆しています。ホテルライクなプライベート空間と充実したアメニティが整えられており、長時間の船旅でもストレスを感じさせない設計が施されています。
東京九州フェリーの客室構成は、カプセルホテル感覚でプライバシーが守られる1名用寝台「ツーリストS」から、広々としたプライベートバルコニーを備えた「デラックス」まで多彩です。家族やグループに最適な4名定員の「ステート」個室も充実しており、船内レストランでは季節ごとの地元食材を活かした本格的な和洋定食や名物メニューが味わえます。洋上の波音を感じながら利用できる露天風呂とサウナは、乗船客から「国内屈指の絶景温浴施設」として絶大な評価を得ています。
一方、オーシャン東九フェリーは、自由度の高いカジュアルステイに特化しています。あえて有人レストランを置かず、24時間いつでも利用できる自販機スペースには、徳島ラーメン、チキン南蛮、焼きおにぎり、冷凍パスタなどの多彩な冷凍食品が整然と並び、各所に設置された業務用電子レンジで温めて飲食できます。「誰にも時間を制限されず、好きな時間に気ままに夜食を楽しめる」という独特のラフな居心地の良さが、リピーターの心を掴んでいます。
さらに注目すべきはペットとの共生環境です。東京九州フェリーにはペット同伴専用の「ウィズペットルーム」が設置されており、ケージ内だけでなく室内で愛犬・愛猫と一緒に滞在できます。船上にはドッグフィールド（屋外ドッグラン）も併設されており、長時間の航行中もペットの運動不足やストレスを軽減できるよう万全の配慮が施されています。ただし、ウィズペットルームは船内にわずか数室しかないため、争奪戦が激しいプラチナチケットとなっています。
